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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

31省份新增本土确诊病例349例、本土无症状感染者3077例******

　　中新网5月10日电 据国家卫健委网站消息，5月9日0—24时，31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例357例。其中境外输入病例8例(广西3例，广东2例，北京1例，福建1例，四川1例)，含1例由无症状感染者转为确诊病例(在广东)；本土病例349例(上海234例，北京61例，河南25例，广东15例，青海10例，辽宁2例，福建1例，贵州1例)，含172例由无症状感染者转为确诊病例(上海156例，河南7例，北京3例，广东3例，辽宁2例，青海1例)。新增死亡病例6例，均为本土病例，均在上海；无新增疑似病例。

　　当日新增治愈出院病例1019例，其中境外输入病例12例，本土病例1007例(上海847例，吉林54例，北京26例，江西15例，黑龙江11例，浙江11例，辽宁10例，广东7例，内蒙古6例，四川5例，湖南4例，山东3例，河北1例，山西1例，江苏1例，安徽1例，河南1例，湖北1例，海南1例，青海1例)，解除医学观察的密切接触者45375人，重症病例较前一日减少18例。

　　境外输入现有确诊病例154例(无重症病例)，无现有疑似病例。累计确诊病例18294例，累计治愈出院病例18140例，无死亡病例。

　　截至5月9日24时，据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例8068例(其中重症病例511例)，累计治愈出院病例207138例，累计死亡病例5191例，累计报告确诊病例220397例，无现有疑似病例。累计追踪到密切接触者3730326人，尚在医学观察的密切接触者394649人。

　　31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者3118例，其中境外输入41例，本土3077例(上海2780例，河南98例，江苏55例，辽宁53例，江西35例，青海17例，北京13例，浙江9例，吉林6例，广东6例，四川3例，河北1例，重庆1例)。

　　当日解除医学观察的无症状感染者8215例，其中境外输入62例，本土8153例(上海7672例，吉林113例，辽宁102例，江西79例，河北40例，山东37例，浙江33例，江苏27例，安徽12例，黑龙江9例，广西8例，山西7例，北京5例，湖北3例，广东2例，新疆2例，贵州1例，云南1例)；当日转为确诊病例173例(境外输入1例)；尚在医学观察的无症状感染者87294例(境外输入452例)。

　　累计收到港澳台地区通报确诊病例728892例。其中，香港特别行政区331306例(出院60636例，死亡9347例)，澳门特别行政区82例(出院82例)，台湾地区397504例(出院13742例，死亡931例)。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）